Le Centre de Recherches et des Technologies des Eaux (CERTE) est un Etablissement Public à caractère Administratif (EPA), doté de la personnalité morale et de l’autonomie financière. Il fait partie de la composante ''recherche'' du Technopole de Borj Cedria (Décret de création N° 337/2005). En 2010 (Décret n° 3483/2010), il a été transformé d’un EPA à un EPST (Etablissement Publique à caractère Scientifique et Technologique).

Le CERTE est structuré en 5 laboratoires de recherche et d'une station pilote à savoir :

1. Le Laboratoire de Géoressources
2. Le laboratoire de Traitement des Eaux Naturelles
3. Le Laboratoire des Eaux Usées et Environnement
4. Le Laboratoire Eau, Membranes et biotechnologies environnementales
5. Le Laboratoire Traitement, Impact et Valorisation des Rejets Hydriques
6. La Station pilote d'El Menzah